被子植物有多年生木本植物如乔木、灌木和藤本，还有很多草本植物；裸子植物都是多年生木本植物，多数是乔木。被子植物大多是两性花，除了雄蕊和雌蕊外，还有花冠和花萼；裸子植物的花都是单性的，一般呈球果状。

被子植物的花粉管中一精子与卵结合，另一精子与二极核结合，这是被子植物特有的双受精现象，被子植物的胚乳是受精的极核发育而成的；裸子植物的花粉管中只有一精子与卵结合，没有双受精现象，裸子植物的胚乳是由雌配子体形成的。

被子植物的胚珠生在雌蕊的子房内，花粉受精后，胚珠形成种子，子房形成果实，种子包在果皮里，如同动物的胎生；裸子植物胚珠是裸露的，种子一般无果皮包裹，成熟时裸露在外，不形成果实，如同动物的卵生。被子植物具有导管和伴胞；裸子植物的木质部中一般没有导管，只有管胞，韧皮部中没有伴胞。